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Pipeline Pilot 产品中心Pipeline Pilot

产品名称(英文):Pipeline Pilot

产品名称(中文):强大的信息整合和流程定制的科学平台

软件厂家:BIOVIA

PDF引见 :点击下载

产品简介:

Pipeline Pilot是美国BIOVIA公司旗下用于信息整合和流程定制的软件,是一款功能强大的信息整合和流程定制的科学平台,它正在优化钻研坐同周期、提高工作效率与减少钻研和IT经费方面能发挥巨大作用。经过历程Pipeline Pilot,用户不但能够大概整合和挖掘杂乱无章的海量钻研数据,自动化数据的理会流程,而且借可以或许实现企业级的研究成果快速理会、可视化与同享,提升大范围的协作才气。

  • 产品详情
  • 常见问题

      Pipeline Pilot是美国BIOVIA公司旗下用于信息整合和流程定制的软件,是一款功能强大的信息整合和流程定制的科学平台,它正在优化钻研坐同周期、提高工作效率与减少钻研和IT经费方面能发挥巨大作用。经过历程Pipeline Pilot,用户不但能够大概整合和挖掘杂乱无章的海量钻研数据,自动化数据的理会流程,而且借可以或许实现企业级的研究成果快速理会、可视化与同享,提升大范围的协作才气。 

      Pipeline Pilot既支持简单的数据格式(文本和数字),又支持重大的科学数据类型(图像、化学组织和生物序列)。科学的广度与深度,再加上BIOVIA公司广泛的合作伙伴,使得Pipeline Pilot能够大概满足众多钻研性家当的各种需求,包含制药、生物技术、材料科学、小我私人消费品、石油、天然气、汽车、航空航天、能源和国防。

Pipeline Pilot经过历程2种方法去优化钻研坐同周期。第一、为科学理会(绿色)供给专业的理会器械,第二、将手动和重复性的数据准备和采集事变(红色)自动化和标准化。因此科学家和工程师能够大概投入更多的时间和肉体去运用专业技能和知识,从而更多天发作知识坐同。

 

Pipeline Pilot 已更新到9.1版本

  •  升级后的客户端运转和启动速度更快。

  •  加入大量新的科学组件。

1、化学方面

     a) 增添了一些新的谋略和瞻望方法。包含:Scaffold Tree、类药性瞻望方法(QED)、可合成性理会(SAscore)

     b) 多种言语的化学称呼组织转换服从

     c) 提升谋略效率

2、文本理会方面

     a) 支持更多的数据格式读取和写入

     b) 刷新搜索服从

3、生物信息学方面

     a) NGS多方面的增强

4、图形措置责罚方面

     a) 易用性的增强

     b) 整合了更多的三方应用

     c) 图像措置责罚的一些新方法

5、用户权限管理方面

     a) 专注于用户权限管理安全性和易用性

 

强大的数据处理才气

      Pipeline Pilot能够大概图形化天定制符合您的要求的数据管理和信息挖掘等科研工作流程。Pipeline Pilot中搜罗了上千个服从的组件(Components),您可以或许凭证自己的需求,将其组合成差异的数据处理流程(Protocols),实现各种服从,如数据检索和措置责罚,化合物各种性质的谋略、选择与展现等。Pipeline Pilot平台借供给了Web效力层接口,允许您将直立的数据处理流程部署正在服务器上,经过历程Web背外界供给效力。

      Pipeline Pilot具有强大的数据处理引擎和灵活的架构,那使得它能完美天处置惩罚研发机构面临的众多难题。Pipeline Pilot具有以下服从:

  •  对文本、数字和包含化学组织、生物序列和科学图像在内的重大数据结构住手数据管理、理会和生成报告。

  •  对工程师、开发人员和领域专家来说,Pipeline Pilot是一个快速的应用拓荒状况,它赞助收集用户需求并将之模型化,从而直接组成一个究竟的产品系统。

  •  供给可用于数据检索、措置责罚、过滤和展现的可设置组件。

  •  应用标准技术去构建自定义组件,这些标准技术包含SOAP/Web Services、Perl、Java和命令行体式格式。

  •  供给一个灵活的、可设置的、面向效力的架构。

  •  供给大量已由实际检验的科学组件和最好工作流,这些组件和工作流涵盖了众多的科学领域。

  •  能够大概整合第三方应用程序、数据库和已有的常用科学器械,包含微软SharePoint、微软Office应用程序、化学制品注册数据库、图像数据管理体系、在线数据库(如PubMed和PubChem)、专利数据库、RCSB(生物序列数据和蛋白质组织)和BLAST(序列数据库)。Pipeline Pilot的开放式架构使得它能够大概整合大量其余的第三方数据资源,包含ODBC、JDBC或网络服务兼容的那些资源。

灵活的数据与应用程序整合才气

      Pipeline Pilot经过历程一系列的标准化技术,能赞助您将各种差异花腔的数据,如内部数据库,文档或任何从企业中获得的数据组织成统一有序的信息,为您的决定企图供给有力凭据。关于科研工作者,Pipeline Pilot借可以或许读取各种通用花腔的化学、生物序列、文本、图像和数字信息并对它们住手实时的理会。同时,经过历程SOAPPerlJavaVB Script和命令行等体式格式,研究人员可以或许把事变相关的第三方软件整合成为新的组件,直立更符合自己科研习俗和要求的数据处理流程,这些新组件将被自动整合为系统模块组件的一部分,能以系统原有组件相同的体式格式与其他用户同享应用。

 

最好流程的同享和部署才气

      正在Pipeline Pilot中,可以或许对数据处理流程实现自动得到,注释和版本编号,借可以或许随意马虎天将直立的数据处理流程宣布给其他研究人员,实现流程同享,使得团队合作拓荒变得更加随意马虎。为了住手更广泛的交流,您以致可以或许将您的数据处理流程经过历程Pipeline PilotWeb接口宣布到网络上,供给基于浏览器的应用体式格式,供更多人的交流和应用。

 

可定制的报告和网络应用的拓荒才气

      正在Pipeline Pilot中,可以或许应用表格、图表、图片和文字等定制数据报告,对数据理会和数据挖掘进程住手总结和展示,并凭据您的自愿假想相宜的报告构造和报告内容,从而更深入天正文所得到的结果。您正在同一张报告中应用表格、图表和图像,可以或许从不同的视角上观察同一份数据,或应用差异的体式格式对差异来源的数据住手相互对比,从而得出合理的结论,为究竟决定企图供给凭据。您借可以或许应用多种花腔输出报告,包含HTMLPDFWordPowerPoint

      为了让您的报告更加生动,您可以或许正在其中加入Web交互元素,如报告内加入超链接,各种信息提示等。您以致可以或许将几个数据处理流程整合成为一个网络应用程序,由最终用户去决意展现哪些数据和用哪种体式格式去展现数据,而不需要最终用户假想任何数据处理流程。

 

系统架构和客户端类型

      Pipeline Pilot回收灵活的系统架构,其服务端支持Windows和Linux平台,并可以或许按Client / Server(客户端/服务器)和Browse / Server(浏览器/服务器)两种情势去部署,使得各种流程和任务能够大概随意马虎天跨平台(Windows/Linux)运转。

 

Pipeline Pilot的主要科学模块和说明以下:

      Pipeline Pilot组件是构成科学信息平台的一个一个 “积木”,它们被凭据科学领域或服从住手分类。研究人员、开发人员和IT专家经过历程这些为数众多的组件既能执行特定的科学理会,也可以或许住手常见的数据处理。他们以可视化的体式格式搭建理会流程,从而实现数据检索、选择、理会和生成报告等服从。

 

Chemistry 化学

Chemistry Collection

      Chemistry模块供给了多种对化合物的选择和学习方法,实现化合物的性质谋略、理会和措置责罚等服从,并能将您的化合物与其他数据库中的化合物住手对比,发现其中性质奇异、组织新颖的分子。其余借能快速枚举和理会组合化学的反响反应产物,识别一系列化合物中的群众子组织,实现第三方措置责罚递次与Pipeline Pilot的无缝跟尾,自动执行对化合物的悉数理会进程。该模块支持绝大多数的家当标准化学花腔,包含来自MDL的MOL、SD、RG、RXN、ISIS,来自Daylight的SMILES、SMIRKS、MARTS、TDT,和常用的MOL2等各种表达化学组织的文件格式,并可实现各种花腔之间的转化。

 

经过历程Chemistry模块,用户可以或许:

  •  兼容大部分家当标准化学数据格式

  •  谋略众多的分子属性和指纹

  •  标准化和措置责罚分子结构

  •  经过历程反应和RGroup枚举组合化合物库

  •  枚举发作生物等电体库

  •  应用Perl和Java工具包去竖立新的化学组件

  •  多个化合物库的标准化和对比

  •  |子组织和相似组织检索

  •  化合物的聚类分析和多样性理会

  •  SAR理会和最大群众子组织检索

1999.net

 

ADMET Component Collection

      ADMET模块能够大概谋略化合物正在生物体内的吸收、漫衍、代谢、吸取和毒性特性,搜罗的模型有:人体肠内吸收瞻望模型、水溶性瞻望模型、血脑阻滞渗透性瞻望模型、血浆卵白结合率瞻望模型、细胞色素P450 2D6遏止率瞻望模型和肝毒性瞻望模型,别的,本模块借能够大概瞻望已知药物的代谢产物。

 

经过历程ADMET模块,用户可以或许:

  •  快速谋略化合物的ADMET性质

  •  清除ADMET特性不佳的化合物

  •  正在剖析之前,评价用于前进化合物ADMET属性的纯化方法

  •  正在化合物理会报告里整合ADMET属性、执行和其余谋略属性

 

CheminformaticsComponent Collection

      Cheminformatics模块用于赞助搭建基于Pipeline Pilot化合物组织查询和浏览的数据库。该模块包含两个主要子系统:LMQS(List Management and Query Services),用于供给已有化合物数据库的搜索和列表管理;PP Direct Chemistry Cartridge,基于Oracle的下性能化合物组织存储和查询的数据库cartridge。应用该模块,可以或许赞助企业搭建多种灵活高效的企业级化学信息学应用平台。

 

经过历程Cheminformatics模块,用户可以或许:

  •  正在不用思考差异化学数据格式、数据库假想和搜索引擎之间的差异的状态下,经过历程便当的Pipeline Pilot数据库检索网页客户端或Web Port应用程序,正在网页上检索大量差异的数据源。

  •  无需批改内在数据库假想和数据,便能随意马虎天整合新的和已有的数据源

  •  经过历程Pipeline PilotDirect Chemistry Cartridge,正在Oracle数据库里存储和搜索化学组织和相互作用

  •  直立用于Oracle数据库里插入、索引和搜索化学数据的流程,而那一切无需用户能干Oracle数据库

  •  运用Pipeline Pilot列表管理服从去竖立流程,该流程能够大概对搜索结果住手可视化、理会和生成报告,并且经过历程Pipeline Pilot数据库搜索网页客户端使得化学家和生物学家皆能访问这些结果

  •  竖立基于Pipeline Pilot的搜索和浏览应用程序,从而简化和减速研发进程

 

Biology 生物

Gene Expression Component Collection

      Gene Expression模块正在开源软件BioConductor的基础上,实现了基因表达执行的数据处理、可视化、理会、标记和报告生成等一系列服从。运用Pipeline Pilot的图形化数据处理流程设计能力,与BioConductor引擎相结合,可直立重大的事变流程,同时也可将基因表达理会与Pipeline Pilot的其他服从的联合,如序列理会、文本理会和报告生成等,以完成更重大的事变,而那一切皆无需任何编程事变。

 

经过历程Gene Expression模块,用户可以或许:

  •  理会和注释基因表达执行

  •  无需编程和熟悉R言语,便能够大概应用BioConductor器械

  •  很容易天竖立用于对比差异理会方法的流程

  •  整合R/BioConductor|司机葡京赌场如何注册和其余的Pipeline Pilot模块的理会,包含R Statistics Sequence Analysis模块

  •  竖立搜罗R发作的图表和Reporting模块理会结果在内的综合分析报告

  •  下载和理会GEO数据集

 

 

Sequence Analysis Component Collection

      Sequence Analysis模块经过历程180多种的序列理会组件供给了一整套的生物信息学器械,将模块化器械与图形化的假想体式格式结合,实现对蛋白质和核酸的序列的注释和特性理会,序列搜索和比对,发作引物和扩增子,siRNA假想,发现限制性酶切位点等服从。一样,本模块可以或许经过历程JavaPerl直立新的组件去扩大系统服从,或经过历程与EMBOSS整合而实现服从的扩大。

 

经过历程Sequence Analysis模块,用户可以或许:

  •  自动化新序列数据的常规理会

  •  跨物种对比基因和基因组

  •  正在理会流程中整合用户的算法

  •  ClustalWMuscleHMMBLAST理会

  •  假想siRNA理会流程

  •  正在理会流程中整合E-UtilitiesEntrez查询服从

  •  和其余模块结合住手更重大的理会

 

 

Mass Spec for Proteomics Component Collection

      Mass Spec for Proteomics模块供给了一系列对基于生物量谱的蛋白组数据处理器械,可以或许对去自量谱执行的数据住手读入、输出、展现、措置责罚、理会、对比和宣布。可以或许和Sequence Analysis和Gene Expression模块住手连用做其他执行数据的理会和生物标记的识别和考据。

 

经过历程Mass Spec for Proteomics模块,用户可以或许:

  •  读取多种数据格式,.RAW*、.wiff、 SEQUEST DTA、 ANDI (netCDF)、 Mascot MGF、或mzXML文件

  •  以多种形式审查用户数据,比如交互式的色谱图、2D量谱运转图、扫描图、峰值图、生存时间草图和热图

  •  应用X!Tandem住手蛋白质因素核定

  •  应用XCMS提取、核定和比对差异图谱间的峰值

  •  以web port交互式的体式格式宣布理会结果

  •  谋略2个样本中卵白丰度的ASAPRatio值

Next Generation Sequencing Component Collection

      Next Generation Sequencing(NGS)模块让用户能够大概理会和理会如今大多数下通量测序仪发作的大量数据集。基于强大的Pipeline Pilot平台,NGS模块带来了很多专门理会NGS数据的组件和流程,服从触及序列拼接、reads定位、RNA-seq数据理会、多态性与组织差异查找和reads选择等多个方面,借可以或许整合其他更多的NGS递次和算法,一同构建NGS信息化平台。

 

经过历程Next Generation Sequencing模块,用户可以或许:

  •  经过历程简单的鼠标拖放支配竖立和执行整套的新数据处理流程

  •  经过历程定制的交互式网页报告去评价理会质量和覆盖率

  •  为任何知识库增添属性,比如基因和dbSNP入口号

  •  经过历程BWA、Bowtie或mapreads比对reads

  •  经过历程Velvet执行de novo拼接

  •  查找SNP、插入、删除和拷贝数改变等信息

  •  浏览用户执行的比对理会统计结果

 

 

Life Science Modeling & Simulation 生命科学建模和模拟*

Catalyst Component Collection (Pharmacophore)

      Catalyst模块搜罗了一整套药效团建模和3D数据库管理工具。Pipeline Pilot整合了着名的Catalyst技术用于竖立自动和易用的事变流程,从而精简了药效团的建模和理会进程。经过历程直立自定义工作流去部署Catalyst的精密算法,这些算法用于生成构象、竖立3D数据库、发作药效团和虚拟选择等服从。

 

CHARMm Component Collection (Simulations)

      CHARMm模块中的组件基于经过广泛考据的CHARMm引擎,这些强大的组件可以或许用来模拟生物分子,从而让Pipeline Pilot的标准服从得以扩大,能为蛋白质、核酸、小分子和蛋白质配体复合物住手稳定而准确的分子力学和分子动力学模拟。

 

* Life Science Modeling & Simulation的模块经过历程Discovery Studio中供给,更多模块服从和细节信息请参考Discovery Studio的相关质料。

 

Materials Modeling & Simulation原料模拟

Materials Studio Component Collection

      Pipeline Pilot中的Materials Studio(MSC)模块,集成并支持Materials Studio(MS)中主要的建模和模拟器械,可以或许为原料钻研的瞻望理会和自动化事变流程供给无缺的软件解决方案。与传统的原料模拟差异的是,经过历程Pipeline Pilot,重大的事变流程能够大概被轻松迅速的拓荒、记载和同享,同时正在与Pipeline Pilot的其余Collection模块相结合后,工作流能够大概正在差异的部门内部更加深化和部署。

MSC模块应用户可以或许经过历程Pipeline Pilot构建多种MS应用程序,包含:

  •  量化器械(CASTEP、DMol3、VAMP)

  •  分子力学模拟器械(Forcite Plus、Amorphous Cell)

  •  晶体结构理会器械(Polymorph Predictor、Reflex、Reflex Plus)

  •  聚合物性质谋略器械(Synthia)

  •  分子性质建模(QSAR)

 

经过历程Materials Studio模块,用户可以或许:

  •  回收属性谋略组件去构建流程,从而轻巧天谋略原料分子的重大属性

  •  可以或许直接读入和输出Materials Studio支持的文件格式,与Materials Studio优胜互动

  •  整合来自Materials Studio的脚本(MS Perl Script)应用程序

  •  具有对周期性组织可视化和生成报告的器械

 

Polymer Properties Component Collection (Synthia)

      Polymer Properties (Synthia) 模块供给了一系列方法,可以或许基于重复单元信息、分子量和温度,对无定型聚合物和随机共聚物的性质住手快速瞻望。该模块供给了一种直立好的模型(来源于J.Bicerano’s  Prediction of Polymer Properties (Marcel Dekker, NY, 2002.))和一种扩大的模型供用户应用。经过历程应用Polymer Properties (Synthia) collection,您只需求指定聚合物中单体重复的单元信息,并选择您希冀瞻望的性质便可以或许最早瞻望了。

 

经过历程Polymer Properties模块,用户可以或许:

  •  瞻望聚合物的众多属性,包含界面张力和交联影响等

  •  直立基于网络的聚合物属性瞻望应用

  •  经过历程回收补充执行数据和直立统计模型去前进瞻望的准确性

 

Reporting & Visualization 报告和可视化

Reporting Component Collection

      Reporting模块为数据理会和挖掘事变定制总结报告。报告中可灵活应用表格、图表、图像和文字等各种元素,并经过历程对报告构造和报告内容的调整,能更清楚天正文和叙述所得到的结果。经过历程正在一张报告内展示多种差异的表格、图表和图像,可以或许正在差异视角上观察同一份数据,或将差异来源的数据用差异的体式格式展示,从而随意马虎对它们住手对比和理会。别的,Reporting模块借可以或许用于假想Web网页,加入各种Web页面中常用的元素与用户交互,从而满足人们差异的要求。

 

经过历程Reporting模块,用户可以或许:

  •  总结和展现来自多个数据源的数据

  •  自动竖立标准化的报告

  •  竖立始终处于最新状态的报告和网络应用

  •  竖立交互性极好的网络应用来挖掘数据的深层信息

  •  正在网络平台上竖立合作项目组的页面

  •  正在文档知识库里竖立文档,歧SharePoint

  •  供应对多来源数据的展现界面

  •  对任何类型的数据住手定制化的可视化

 

Database & Application Integration 数据库和应用程序整合

Integration Component Collection

      Integration模块供给了强大的集成服从,能够大概把现有的内部或第三方递次和数据库无缝集成到Pipeline Pilot中,因而能充分利用现有的谋略资源。被整合入Pipeline Pilot的应用器械可以或许像系统原有的模块组件一样被随意马虎的应用。本模块应用JavaPerl.NetVBScriptSOAP等技术将现有的内部递次或第三方递次作为组件整合入Pipeline Pilot,应用ODBC技术从诸如OracleSQLServer等数据库中得到数据,理会数据和生成报告,并能将结果直接存入数据库。

 

经过历程Integration模块,用户可以或许:

  •  正在自己公司的数据库里直接更新数据和存储结果

  •  整合已有的内部和第三方递次

  •  回收标准脚本状况去快速拓荒新组件

  •  整合交互式的桌面应用器械

 

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Imaging 图像措置责罚

Imaging Component Collection

      Imaging模块为图片数据的加工措置责罚、理会、测量和报告供给了一个直观的企业级软件平台,增强了Pipeline Pilot图像措置责罚事变的流程自动化和可视化编程才气,能将图像数据与数值、化学、图片和文本数据整合成为统一的事变流程数据。可以或许用于下内涵选择(HCS)中图像的自动化理会、统计和措置责罚。

 

经过历程Imaging模块,用户可以或许:

  •  竖立自动化的流程用来分割、标注和注释图像和目标

  •  测量多通道图像中目标的数字和统计属性

  •  对图像的象素值住手各种各样的数学支配

  •  正在一个开放的平台上兼容几乎所有的标准图像文件花腔

  •  |1999.net能措置责罚图像和非图像数据

  •  扩大了Pipeline Pilot服务器架构的稳定性、部署和质量把握才气

  •  正在一个可视化和互动性优胜的框架里,能很随意马虎天措置责罚和管理图像

 

 

Analysis & Statistics理会与统计

Data Modeling Component Collection

      Data Modeling模块供给了一套用于学习和建模的器械,统计性的选择器,和专为大数据集优化过的分类器械,不但能够大概住手数据特性理会和挖掘数据,借能能够大概赞助直立合理的具有瞻望才气的模型,为研究工作或商业决定企图供给咨询。应用那部分组件,可以或许实现如快速数据分类、贝叶斯学习、主成份理会和恰恰最小二乘回归等数据理会方法,与Chemistry模块中的组件结合应用,可以或许实现组织-活性模型的构建、化合物分类和最大群众子组织查询等服从。

 

正在Data Modeling模块里,用户可以或许经过历程以下方法对数据住手理会和建模:

  •  相似性和聚类分析方法

  •  Categorical learning

  •  主因素理会 (PCA)

  •  Linear regressionpartial least squares (PLS) regressionk-nearest neighbor (kNN) regression

  •  ROC图、富集理会图和其余用于评价建模质量的可视化技术

 

Advanced Data Modeling Component Collection

      Advanced Data Modeling模块主要供给了递归离别(Recursive Partitioning, RP)和多目标帕累托优化(Multiobjective Pareto Optimization)两种数据建模方法。其中RP法中搜罗single treeforest tree学习法,能够大概告别对单变量和多变量住手学习。帕累托优化组件可用于处置惩罚多目标的优化问题,为评价两个或多个部分抵牾目标之间的衡量标准供给解决方案。

 

正在Advanced Data Modeling模块里,用户可以或许经过历程以下3类组件对数据建模:

  •  Recursive Partitioning组件(决策树)

  •  Genetic Function Approximation (GFA) 组件

  •  Pareto Optimization组件

 

R Statistics Component Collection

      R Statistics模块能对数据住手深切细致的理会,竖立内容丰富、清晰直观的理会图表,赞助您做出合理的决定企图。R统计模块搜罗的组件能够大概实现数据支配、聚类、学习,和一些传统和探究性的数据理会方法,其统计引擎来自于正在群众领域广泛应用的R统计学软件包。R统计学软件包中的数据统计和理会方法被无缝跟尾到Pipeline Pilot数据流程中,用户可以或许直接调用其组件而无需编写R脚本语言,所得到的输出结果可以或许直接用Pipeline Pilot事变流程中的其余组件住手理会。本模块中主要的学习方法有恰恰最小二乘法,神经网络和支持向量机等。R脚本语言编写的组件一样可以或许直接整合到Pipeline Pilot中,从而扩大R模块中的组件服从。

 

经过历程R Statistics模块,用户可以或许:

  •  正在一个热图里展现多个属性的相关性,发现最相关者

  •  应用箱线图观察数据正在各个子集的漫衍状态

  •  执行方差分析以决意多个数据集平均值的差异性

  •  经过历程多种方法住手数据建模,比如支持向量机和野生神经网络

  •  应用自定义的模型对新数据集住手瞻望

  •  允许随着执行数据的络绝获得去扩大模型

  •  回收多种差异的散类方法

  •  允许用户对数据应用自有的R脚本

 

 

Document Search & Analysis 文档挖掘和理会

Text Analytics Component Collection

      Text Analytics模块供给了很强的文献检索和文本质料挖掘的服从,将文献检索、特性数据提取和表征等步骤整合为一个自动化的流程,可以或许实现最具挑战性的文本数据挖掘进程。经过历程整合文献检索和文献描写到自己的科研流程中,抵达交互或自动完成包含内部(本机)和内部(互联网)文本数据资料挖掘的目的。

 

经过历程Text Analytics模块,用户可以或许:

  •  搜索PubMed、美国和欧洲专利、雅虎新闻、本地文件,借可以或许整合第三方的搜索引擎

  •  应用一条查询语句去搜索多个数据源

  •  正在本地文档和在线文献中提取关键看法或查找关联性

  •  凭证内部和在线文献,扩大一样寻常生物和化学任务的注释信息和相关性

  •  发现新兴的趋势和关联性,理会用户领域的专利状态

  •  竖立薄弱的、交互式的报告去挖掘用户文档中的深层信息

 

 

ChemMining Component Collection (Chemical Text Mining)

      ChemMining模块供应对内部(本机)和内部(互联网)文献的化学相关文本检索服从,对受珍重的知识产权住手全面的视察,从而阻止研究人员住手重复的研究工作。本模块中的组件能对文档住手快速的检索,为找到的化合物直立一份报告,并能将检索到的化合物称呼转化为化学结构式以随意马虎后续的研究工作。其余,您借可以或许一次性措置责罚大量的文件,并为搜索到的化合物直立数据库以便查询。将化学结构式检索和文本检索结合起来,可实现更具针对性的,更智能的检索体式格式。

 

经过历程ChemMining模块,用户可以或许:

  •  凭证正在摘要、专利和内部文档中发现的组织去竖立可搜索的数据库,用户可以或许正在其中住手智能查询

  •  搜索PubMed的摘要和专利去发现化学组织

  •  从内部文档和其余文件中查找化学制品称呼,包含自定义和群众的称呼

  •  竖立搜罗了已发现的组织和感兴趣的术语的报告

  •  直立整合了文献和化学分析的灵活理会流程

 

 

Laboratory 实验室数据理会

Plate Data Analytics Collection

      Plate Data Analytics模块供给了对孔板数据的读、写、报告、可视化、支配和谋略等服从,数据处理流程中的每一条数据记载皆可以大概对孔板上的单孔数据或整版数据住手措置责罚。运用Pipeline Pilot的图形化数据处理流程设计能力,无需编写代码便能实现如理会选择结果这样的重大的数据理会进程,结合Integration模块,借可实现孔板数据正在数据库中的存储和读取服从。

 

经过历程Plate Data Analytics模块,用户可以或许:

  •  定义了理会各种选择实行结果的自动化递次

  •  正在孔板内部和孔板之间执行统计谋略,比如自动谋略IC50曲线

  •  Pipeline Pilot自己的器械、R统计或Graph Pad Prism方法住手剂量反响反应谋略

  •  可视化和数据挖掘孔板数据信息

  •  经过历程与Integration模块结合,直接从数据库插入或获得孔板数据

 

 

Analytical Instrumentation Collection

      Analytical Instrumentation模块供应对实验室中的理会谱图数据的得到和措置责罚。应用该模块,可以或许对理会谱图数据自动措置责罚、发作报告,并且与其他部门同享。常用的谱图措置责罚服从包含:谱图峰识别、峰面积积分、配景去除、平滑、傅里叶转换等。而专门的NMR数据处理模块,可以或许实现FID到化学位移的一步自动转化,并可以或许从化学组织发作(同时支持C13和质子位移)NMR谱图。可以或许读入的谱图花腔包含JCAMP-DX、SPC、RheoML、AnIML,也支持Bruker和Varian的NMR花腔。

 

经过历程Analytical Instrumentation模块,用户可以或许:

  •  更有效地正在部门内部分享谱图理会结果

  •  经过历程活动重复的理会流程,整合理会算法和分享最好的数据理会实际去前进理会才气

  •  竖立能满足用户络绝改变需求的报告,从而降低谱图理会的费用

  •  整合孤立的数据,直立相互协作的钻研状况

 

 

 

 

产品咨询:

021-51821768转219 (沪办)

010-82676188转213 (京办)

►  问:什么是Pipeline Pilot?

     答:Pipeline Pilot是强大的科学信息集成、数据理会和流程定制平台。


►  问:Pipeline Pilot有哪些特性?

     答:A、 Pipeline Pilot能够大概整合多种类型的执行数据和软件
           B、 把一样寻常的科研工作理会成流程,把各种科学功能模块化成Component(组件),以图形化体式格式灵活天编写Protocol(事变流程/任务),并可以或许随意马虎随时更改;
           C、 流程随意马虎同享,并可以或许经过历程Web网页去调用曾定制好的流程。


►  问:Pipeline Pilot有哪些科学模块?

     答:Pipeline Pilot具有众多科学模块,包含:Chemistry化学、Biology生物、Life Science Modeling & Simulation生命科学建模和模拟、Materials Modeling & Simulation原料模拟、Reporting & Visualization报告和可视化模块、Database & Application Integration数据库和应用程序整合、Imaging图像措置责罚、Analysis & Statistics理会与统计、Document Search & Analysis文本挖掘和理会、Laboratory实验室数据理会。


►  问:Pipeline Pilot的Component(组件)是什么?

     答:Component是竖立工作流的组成模块。每一个component执行一定的服从,比如读入数据、理会数据、输出数据等。Component可以或许具有一个数据入口和最多两个数据出口。每一个Component具有自己的参数面板,经过历程设置或窜改参数去把握该component的服从。

 

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